La comprobacion del path estaba hecha al reves :c

src/danielcortes/xyz/controllers/InformesController.java

@@ -125,8 +125,8 @@ public class InformesController {
         chooser.setFileFilter(new FileNameExtensionFilter("Excel 2007", "xls"));
 
         if (chooser.showSaveDialog(this.view.getContentPanel()) == JFileChooser.APPROVE_OPTION) {
-            String filename = chooser.getSelectedFile().toString();
-            if (FileUtils.isValidPath(filename)) {
+            String filename = chooser.getSelectedFile().getPath();
+            if (!FileUtils.isValidPath(filename)) {
                 JOptionPane.showMessageDialog(this.view.getContentPanel(),"El archivo seleccionado no es valido","Archivo no valido", JOptionPane.ERROR_MESSAGE);
                 return null;
             } else if (!filename.endsWith(".xls")) {

src/danielcortes/xyz/utils/FileUtils.java

@@ -32,6 +32,7 @@ public class FileUtils {
         try {
             Paths.get(path);
         } catch (InvalidPathException | NullPointerException ex) {
+            ex.printStackTrace();
             return false;
         }
         return true;